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太平洋に1,000を超える島が散らばるポリネシアの中で、ハワイとラパ・ヌイ（イースター島）は、互いにいちばん遠く離れた2つの島です。距離はおよそ7,000km。どちらの島も、いちばん近い有人の島から3,000km 以上離れています。人が住む陸地としては、地球上でこれ以上ないほど孤立した場所です。
その2つの島の人々が、遺伝的には互いにいちばん近い間柄だった。2026年10月8日に Science に載った論文が、そう報告しています。ハワイの先住民とラパ・ヌイの人々は、同じ「超長距離航海者」の集団から枝分かれした人々で、その集団の根は、フランス領ポリネシアのマンガレヴァ諸島にありました。
数人のゲノムに、無数の祖先が詰まっている
論文の筆頭著者はカリフォルニア大学サンタクルーズ校ゲノミクス研究所の Cole Shanks さんで、責任著者は同校とスタンフォード大学を兼ねる Alexander G. Ioannidis さんと、カリフォルニア大学サンディエゴ校の Keolu Fox さんです。Fox さんはハワイ先住民の出身で、ゲノム科学の博士号を取った最初のハワイ先住民だと Honolulu Civil Beat は紹介しています。
材料は、ポリネシア各地の1,050人の全ゲノムです。ここには317人のハワイ先住民と、ラパ・ヌイの12人の未発表のゲノムが含まれます。さらに、米国の研究プログラム「All of Us」のバイオバンクから、ハワイ先住民・サモア人・トンガ人のデータも使いました。ひとりのゲノムには両親、4人の祖父母、その親、と無数の祖先の情報が畳み込まれているので、島ごとに数人ぶんあれば、その島に渡った人々の歴史が読める、と Ioannidis さんは Live Science に話しています。
チームはまず、機械学習の道具で各ゲノムの中からポリネシア由来の染色体の区間だけを取り出しました。ハワイやポリネシアの人々のゲノムには、近代以降の移民に由来する区間も混ざっているからです。そのうえで、2人のあいだで同じ祖先から受け継いだ区間（同祖性の区間）の長さを比べました。共有する区間が長いほど、共通の祖先が近い時代にいたことになります。
いちばん遠い2つの島が、いちばん近かった
島ごとの集団の近さから系統樹を組み、データを取り直して2,500回描き直すと、ハワイとラパ・ヌイが隣り合う樹が61% を占めました。次に多かったのはマンガレヴァとの組み合わせで約10%、マルキーズ諸島は3% 未満でした。ハワイとラパ・ヌイは、ポリネシアの中で最も強い「ボトルネック」、つまり少人数での入植を経た2つの集団でもあります。
論文の要旨は、この2つの島は同じ超長距離航海者の集団によって入植され、その集団の祖先の根はマンガレヴァにある、とまとめています。マンガレヴァはハワイの南東約5,500km、ラパ・ヌイの西約2,600km にある島々です。報道では「ラパ・ヌイから一部がハワイへ渡った」と書く記事もありますが、Fox さんは Civil Beat の取材に、ゲノムからはどちらの島が先でどちらを経由したかは決められないと話しています。言えるのは、マンガレヴァから枝分かれしたあと、ある期間をひとつの集団として過ごした人々が、やがてハワイとラパ・ヌイへ分かれて渡った、というところまでです。
この結果は、考古学や言語学の見立てと合います。ハワイ大学マノア校の考古学者 Patrick Kirch さんは Live Science に、考古学で見えていたことと非常によく一致していて、独立した手法が同じ答えを出すことは研究者に大きな確信を与える、と話しています。
年代も読めました。タヒチの581人のゲノムからは、島に最初に渡った集団は繁殖年齢の人がおよそ800人で、時期は1070年ごろと推定されました。放射性炭素年代による見積もり（1025〜1120年）と重なります。ラパ・ヌイへの入植は1210年ごろ。さらに、9〜10世代前に人口が4割近く減った痕跡もあり、ヨーロッパ人との接触後に持ち込まれた病気の時期にあたります。
入れ子になった「少人数の入植」が残したもの
この研究のもうひとつの柱は、「創始者効果」です。少人数の集団が新しい土地に渡って増えると、たまたまその数人が持っていた珍しい遺伝子の変異が、増えた集団の中でありふれたものになります。ポリネシアでは、少人数で渡った島から、また少人数が次の島へ渡る、ということが何度も繰り返されました。論文はこれを「入れ子になった創始者効果」と呼び、東ポリネシアで積み重なった効果は、同じ現象がよく調べられているフィンランド人やアーミッシュより1桁大きいと見積もっています。
積み重なった効果は、いまの人々の体に残っています。チームは、両親の両方から受け継ぐと発症する病気に関わる3つの変異を見つけました。目の水晶体がずれる病気に関わる ADAMTSL4、進行する視力の低下に関わる PDE6B、まれな腎臓の病気に関わる FAN1 の変異です。フランス領ポリネシアでは、それぞれおよそ40人に1人、27人に1人、45人に1人が保因者でした。FAN1 の変異は東ポリネシアで1% を超えるのに、世界の80万人超のゲノムを集めたデータベース gnomAD には1つも登録がありません。
この点が、研究者が強調するところです。フィンランド人やアーミッシュでは、創始者効果で増えた変異が分かったことで、その集団向けの遺伝子検査が整いました。ハワイ先住民は、人口が米国のアーミッシュの2倍ほどある大きな集団でありながら、同じような検査の指針がまだありません。世界的な参照データベースにポリネシアの集団が含まれていないので、ポリネシアの人に多い変異が見落とされたり、意味を取り違えられたりする可能性がある、と Fox さんは指摘しています。
ただし、ハワイ先住民だけの変異の頻度は、この論文には出ていません。All of Us のハワイ先住民のデータは人数が少なく、近代以降の移民に由来する区間も混ざっていたため、統計的に十分な数字が出せなかったからです。間違った数字を出すより、出さないほうがよい、と Fox さんは話しています。
データは誰のものか
先住民のゲノム研究には、データが研究対象の人々のために使われるべきだという「先住民のデータ主権」の考え方があります。チームはこの原則のもとで研究を進めたと述べていて、フランス領ポリネシアでは、参加者と利益を分かち合う仕組みを持つ企業 Variant Bio と組んで、現地の人々と一緒にゲノムを集めています。All of Us のデータについては、参加者の同意がどこまで及ぶかを気にして使うことをためらったが、公開されたデータだったので使った、と Fox さんは説明しています。
次の段階として Fox さんが挙げるのは、ハワイ先住民1,000人以上のゲノムを、ハワイの中に置いたサーバーで管理する新しいデータセットです。ハワイの伝統的な土地区分ごとに100人ほどを集め、祖父母の出身地まで尋ねる計画だといいます。1,000年のあいだ地球でいちばん遠い場所にいた人々が、医療においては遠い存在でなくなる、それがこの研究の先に見据えられているものです。
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出典
- Shanks, C. et al. (2026) “Message in a bottleneck: Nested founder effects from French Polynesia to Rapa Nui and Hawaiʻi” Science 394(6820), 216–221（2026年10月8日）https://doi.org/10.1126/science.aec7662
- Ioannidis, A. G. et al. (2021) “Paths and timings of the peopling of Polynesia inferred from genomic networks” Nature（同じチームの先行研究）https://doi.org/10.1038/s41586-021-03902-8
- Honolulu Civil Beat “Native Hawaiians Didn’t Descend From Where You May Think”（2026年10月、Olin Lagon による Keolu Fox へのインタビュー）https://www.civilbeat.org/2026/10/olin-lagon-native-hawaiians-didnt-descend-from-where-you-may-think/
- Live Science “Native Hawaiians and Easter Islanders came from same ‘ultravoyager’ group”（2026年10月27日、Charles Q. Choi）https://www.livescience.com/archaeology/native-hawaiians-and-easter-islanders-came-from-same-ultravoyager-group
- ScienceAlert “Scientists Have Discovered Where Native Hawaiians Came From, And The Genetic Effect of Their Long Voyage”（2026年10月27日、Ivan Farkas）https://www.sciencealert.com/scientists-have-discovered-where-native-hawaiians-came-from-and-the-genetic-effect-of-their-long-voyage
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